Sekolah ini mulai dirintis awal tahun 2012, dan mendapatkan surat izin rekomendasi penerimaan peserta didik baru dari Dinas Pendidikan Kabupaten Cirebon Senin, 8 April 2013,memperoleh NPSN (nomor pokok sekolah) pada tanggal 17 juni 2013 dengan no NPSN 69795913 serta diresmikan Senin 24 Juni 2013 oleh Buya Yahya Pengasuh Lembaga Pengembangan Dawah Al Bahjah. Setelah 2 tahun berjalan SDIQU Al-Bahjah memperoleh izin pendirian dari Dinas Pendidikan Kabupaten Cirebon pada tanggal 12 september 2015,dengan nomor: 421.1/2609/Disdik/2015. Sekolah ini berstatus lembaga pendidikan swasta yang berlaku sejak lembaga ini diresmikan sampai batas waktu yang tidak ditentukan lamanya.

VISI & MISI

PROGRAM UNGGULAN

1. Tahfidzul Qur’an
2. Tahsinul Qur’an dengan metodologi Tashili
3. Pembiasaan asma’ul husna, bersuci, shalat dhuha, shalat fardlu berjamaah.
4. Program pesantren ramadhan
5. Lingkungan Sosial Pondok Pesantren
6. Pantauan keaktifan menjalankan ibadah sehari-hari
7. Penganugrahan siswa berprestasi “Bintang Prestasi”
8. Pembiasaan pengenalan penerapan bahasa Arab; ‘afwan-syukron, ruhsoh, isim dhomir dan kata-kata yang biasa di sebutkan sehari-hari.
9. Eduislamic fun learning system (sistem pembelajaran islami yang menyenangkan)
10. Perjusa (Perkemahan Jum’at Sabtu)
11. Outing Class
12. Program literasi santri
13. Program konsumsi sekolah (makan siang)
14. Pembinaan minat dan bakat siswa melalui ekstra kurikuler
15. Boarding School dan Antar Jemput Sekolah 

PENGEMBANGAN POTENSI DAN KECAKAPAN HIDUP SISWA/ EKSTRA KURIKULER

TARGET KUALIFIKASI LULUSAN

1. Berkualitas dalam bidang akademik
2. Mampu membaca Al Qur’an dan Ghorib dengan baik dan benar
3. Memiliki kecakapan dasar berbahasa Arab
4. Hafal minimal 5-10 juz Al Qur’an
5. Tertib menjalankan ibadah
6. Berakhlaqul  karimah.